Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3095E9Q058 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3095E9Q058 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184 ms