Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcom1E9PZ54 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcom1E9PZ54 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcom1E9PZ54 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms