Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Brd1E9PZ26 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brd1E9PZ26 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms