Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim30dE9PWL0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim30dE9PWL0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms