Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc175E9PVB3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc175E9PVB3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms