Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Syde2E9PUP1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Syde2E9PUP1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Syde2E9PUP1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms