Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zscan18E9PUD6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zscan18E9PUD6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zscan18E9PUD6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zscan18E9PUD6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms