Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms