Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
4930407I10RikD3Z5T8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
4930407I10RikD3Z5T8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
4930407I10RikD3Z5T8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
4930407I10RikD3Z5T8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
4930407I10RikD3Z5T8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms