Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms