Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kif28pD3YXS5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kif28pD3YXS5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms