Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
9230113P08RikD3YWX3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
9230113P08RikD3YWX3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
9230113P08RikD3YWX3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms