Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc11B2RXC1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trappc11B2RXC1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc11B2RXC1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms