Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rd3lB2RV38 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rd3lB2RV38 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rd3lB2RV38 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms