Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usf3B2RUQ2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usf3B2RUQ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms