Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf518bB2RRE4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf518bB2RRE4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518bB2RRE4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518bB2RRE4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms