Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf3B2RQG2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf3B2RQG2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf3B2RQG2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf3B2RQG2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf3B2RQG2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf3B2RQG2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf3B2RQG2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf3B2RQG2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf3B2RQG2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf3B2RQG2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf3B2RQG2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf3B2RQG2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf3B2RQG2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Phf3B2RQG2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms