Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a6B1AVK5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a6B1AVK5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms