Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtpruB1AUH1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtpruB1AUH1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PtpruB1AUH1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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