Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slfn8B1ARD8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms