Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Supt3B0QZW4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Supt3B0QZW4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Supt3B0QZW4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms