Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prss40A6H6T1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prss40A6H6T1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prss40A6H6T1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms