Protein–RNA interactions for Protein: A6H5Y3

Mtr, Methionine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrA6H5Y3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MtrA6H5Y3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MtrA6H5Y3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MtrA6H5Y3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MtrA6H5Y3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MtrA6H5Y3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MtrA6H5Y3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MtrA6H5Y3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MtrA6H5Y3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MtrA6H5Y3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MtrA6H5Y3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MtrA6H5Y3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MtrA6H5Y3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MtrA6H5Y3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MtrA6H5Y3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MtrA6H5Y3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MtrA6H5Y3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MtrA6H5Y3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MtrA6H5Y3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MtrA6H5Y3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MtrA6H5Y3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms