Protein–RNA interactions for Protein: A2BFE8

Prrg1, Proline-rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg1A2BFE8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrg1A2BFE8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrg1A2BFE8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrg1A2BFE8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrg1A2BFE8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrg1A2BFE8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrg1A2BFE8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrg1A2BFE8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrg1A2BFE8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrg1A2BFE8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrg1A2BFE8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms