Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhl41A2AUC9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhl41A2AUC9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Klhl41A2AUC9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhl41A2AUC9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.8 ms