Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GabreA2AMW3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GabreA2AMW3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GabreA2AMW3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GabreA2AMW3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms