Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.58■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FocadA2AKG8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FocadA2AKG8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FocadA2AKG8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FocadA2AKG8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FocadA2AKG8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms