Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prdm12A2AJ77 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm12A2AJ77 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm12A2AJ77 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms