Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pramel3A2AHA7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pramel3A2AHA7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Pramel3A2AHA7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms