Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ambra1A2AH22 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ambra1A2AH22 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ambra1A2AH22 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ambra1A2AH22 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms