Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nup62clA2AG10 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nup62clA2AG10 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup62clA2AG10 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms