Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C87977A2A958 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C87977A2A958 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C87977A2A958 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C87977A2A958 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C87977A2A958 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C87977A2A958 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C87977A2A958 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C87977A2A958 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C87977A2A958 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87977A2A958 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C87977A2A958 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C87977A2A958 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87977A2A958 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms