Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd5A2A8L1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chd5A2A8L1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd5A2A8L1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd5A2A8L1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms