Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calcoco2A2A6M5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Calcoco2A2A6M5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calcoco2A2A6M5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms