Protein–RNA interactions for Protein: A2A5R2

Arfgef2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef2A2A5R2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arfgef2A2A5R2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Arfgef2A2A5R2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Arfgef2A2A5R2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arfgef2A2A5R2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms