Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Akap17bA2A3V1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Akap17bA2A3V1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Akap17bA2A3V1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms