Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1bA1Z198 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1bA1Z198 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1bA1Z198 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms