Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTR2

0610012G03Rik, RIKEN cDNA 0610012G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
0610012G03RikA0A0J9YTR2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms