Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms