Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm3550W4VSN7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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