Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms