Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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