Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3Q9Z2D8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms