Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdpk1Q9Z2A0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdpk1Q9Z2A0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms