Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn13Q9Z0S4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms