Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gpc6Q9R087 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gpc6Q9R087 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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