Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms