Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csnk1eQ9JMK2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242 ms