Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dclk1Q9JLM8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms