Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cabp1Q9JLK7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms